内部审计信息建设之路并不是一帆风顺，在这个过程中，面临着很多问题亟待解决。

1、专业人才的缺失。在人才市场中，懂得技术的人并不少，但既能掌握信息技术又懂得审计的复合型人才却很稀缺。内部审计信息建设中，人才自然是关键。

2、缺少信息建设团队。一个完善的审计信息建设团队包括信息化建设与系统维护，数据挖掘，数据分析。现在，很多审计部门并没有独立的团队执行审计信息化建设。

3、信息系统应用不充分。有的内审部门买来现成的系统后，只是使用其中的一部分功能，或者没有把应该纳入信息系统管理的工作纳入进去，使信息系统的作用不能充分发挥。信息系统应用不充分将导致审计人员不能从信息化中获得好处，还导致无法对信息化建设的升级改造提出更多的建议。

4、系统功能单一，分析功能不强。审计作业管理系统不能有适时的复核、监控和复核功能，那也只能是审计电子档案管理系统了，只能存放审计底稿、资料。

5、对数据字化转型理解不深刻。审计部门负责人只知道数字化转型是未来审计的趋势，不知道信息化、数字化、数据化的区别是什么，不知道大数据技术的核心是什么。