内部审计管理系统指内部审计机构对审计活动所进行的计划、组织、指挥、协调和控制活动。内部审计管理的目标在于保证审计工作的质量,提高审计工作人员的效率,体现审计工作的独立性、权威性以及公正性,从而可以更好地发挥审计职能的作用。

内部审计管理系统包括财务收支审计、经济效益审计和经济责任审计。财务收支审计对公司机关各部门及所属单位的财务收支的真实性、有效性和合规性的审计。经济效益审计是为了提高公司的经营水平和发展水平，通过内部审计找出经营管理中的存在的问题。经济责任审计是对经济责任人所承担的经济责任的执行情况进行审查。通过经济责任审计可以检查经济责任人在履职期间是否有违规的行业发生，一般侧重于经营责任目标的审计。同时它也是结合日常的财政财务收支审计及经济效益审计进行的，并通过审计资料和信息的积累，为离任责任审计服务。